Buenos días Juan, en realidad tienes que considerar que Packet Tracer es un SIMULADOR no un EMULADOR. Packet tracer no está utilizando un sistema operativo REAL, simplemente está intentando «copiar» el comportamiento del sistema operativo, Packet Tracer tiene muchos errores y bugs PERO te sirve para el examen CCNA ¿por qué?, porque en CCNA solo se analizan configuraciones muy básicas. Cuando intentes aprobar tu examen CCNP o CCIE, te darás cuenta que Packet Tracer se queda muy muy corto, necesitas tener comportamientos más reales de los dispositivos y los protocolos que se utilizan, y es ahí donde GNS3 le toma ventaja, GNS3 utiliza el SISTEMA OPERATIVO REAL, es como si tuvieras el dispositivo en tus manos, lo que ocurre en GNS3 es lo que ocurrirá cuando configures un equipo 100% REAL.
A medida que avances en tu preparación, te iras olvidando de Packet Tracer y no será porque lo quieras, sino porque necesitas un emulador real de dispositivos.